兩岸互設辦事處，
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，應為政府代表。前海基會副董事長邱進益提醒，
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，未來海基會在北京設置辦事處，
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，要特別強調兩岸是對等、信使之間的往來，
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，並非如大陸各省在北京設置「駐京辦」的性質。陸委會前副主委趙建民則強調，
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，兩會互設機構未來無論什麼形式，
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，都不會是駐京辦，
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，因過往海基會與海協會簽署多項協議，
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，都顯示出兩岸不是地方與中央的隸屬關係。
前海基會副董事長邱進益、陸委會前副主任委員趙建民9日出席淡江大學中國大陸研究所暨所友會舉辦的「兩岸互設辦事處的挑戰與機遇」座談會時共同指出，
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，兩岸未來互設辦事處，絕不是大家所想的駐京辦的性質。
此外，邱進益在會中強調，兩岸兩會互設辦事機構有助建立兩岸制度性溝通，而互設機構就是要讓對方以明示的方式來承認我國的治權，這對我國來說是跨出很大的一步。邱進益指出，「假如兩岸辦事處能夠順利完成，做為長期制度性的溝通管道，可傳達正確的訊息，避免未來兩岸可能出現誤解、誤判及誤讀的現象產生。」
邱進益認為，未來駐北京的代表，不能認為只是某機構的代表，辦事機構代表實質上就是代表中華民國政府的政府代表，也就是代表政府的信使。邱進益也強調，目前我國有許多台商長期居住在大陸，長久以來沒有在大陸設機構是政府嚴重失職。「設立一個機構除了可以讓對方以明示的方式來承認我國的治權之外，也是為兩岸關係正常化、制度化前進一大步。」
另外，邱進益也提到，海基會駐北京辦事處一定要爭取維也納領事關係公約的待遇，否則這個辦事處將無法運作。「海基會在北京設置的辦事處，並非大陸各省在北京都有設置『駐京辦』的性質，一定要特別強調兩岸是對等、信使之間的往來，因此當我們爭取到領事關係公約的待遇時，也代表實質平等的兩岸關係。」
邱進益表示，慎選代表人選是關鍵，現在兩會以副祕書長層次的談判其實是不夠，當兩岸互設辦事處的問題逐漸升高的時候，政治敏感度也相對提高，絕對不是兩會所能憑據。因此他鄭重建議，應該要慎選代表人選，最好是具有國際談判的能力，因為這會關係到對方看待我國份量的問題，假如我國駐北京代表份量夠的話，也會受到對方尊敬。
「兩會互設機構未來無論以什麼形式，都不會是駐京辦。」趙建民認為，海基會與海協會簽署過多項協議，都顯示出兩岸不是地方與中央的隸屬關係。另外，海基會駐大陸辦事機構根據兩岸人民關係條例設立，在憲法架構下也不會與駐京辦等同。
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