去年發生菲國海巡掃射台灣漁船「廣大興」號，
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，導致船長身亡事件，
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，我方一度凍結輸台外勞，
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，隨著菲方致歉後已經解禁。
南海問題方面，
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，菲律賓態度相對友善。過去太平島興建機場前，
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，曾有我方官兵急病，送往菲國緊急救治，或由菲方空投藥品的前例。近年政府對太平島態度轉趨積極，開始修建跑道、碼頭等設施，菲方的反彈也遠不及越南等國家強烈。軍方也有某程度的交往，過去國軍C-130運輸機的「海洋長途」訓練科目，曾以菲國為目的地；去年菲律賓中部遭遇嚴重風災，菲方也允許我軍機與軍艦載運物資救援。
菲國為了發展觀光，大量給予外國旅客入境免簽，總數達到一百五十七個。但對於台灣與中國大陸，馬尼拉當局至今仍拒絕給予免簽，菲國官員透露，許多台灣人來菲從事電信詐騙案、大陸人士非法居留或經商，是菲方不敢鬆綁的主要理由。，