陸委會前副主委張顯耀涉及案情，
自然排序
，一度被上綱為「共諜案」；陸委會高層官員今天表示，
複寫聯單
，陸委會掌握的檢舉內容，
玻璃DIY
，只知道張顯耀交付出去列為機密的資訊，
桃園打掃
，但仍然不知道他如何交付，
男內褲
，以及交付的對象是誰，
泡腳桶
，陸委會第一時間，
樹德
，並無法判定張所涉的情況，有無到達後來調查局所稱「共諜」的地步。
對於張顯耀案衍生出許多陰謀論，高層官員表示，對張顯耀所涉的責任問題，陸委會的立場一直「就事論事」，也就是張顯耀在「工作上有疑點」，必須進一步釐清。
官員說，目前只知道張顯耀交付出去列為機密的資訊，但仍不知道他如何交付，以及交付的對象是誰？陸委會第一時間也無法判定張涉案有無到達後來調查局所稱「共諜」的地步。
而至於為什麼要先將張顯耀調職，官員說，主要是兩個考量：一是張在工作上接觸很多機密業務，既有疑慮即應先予調離，二是張是特任副主委，直接負責督導與參與各項工作，如仍在位，調查無法進行。
至於何以要給張顯耀一個董事長的職位？高層官員說，首先，必須要給張顯耀有公平說明的機會，其次是雖然有疑慮，但未能證明他犯罪前，法律上仍應予無罪推定，先視為無罪，以維繫當事人的名譽。
官員說，這是主委王郁琦「比較仁慈的處理」，顧念張顯耀母親病重，生活上仍要有所支柱；對於因為這樣處理，反而如今授人以柄，陸委會也頗無奈。
關於此案對於兩岸關係的影響，官員說，兩岸事務不是一個人能夠決定的，兩岸協商已經制度化，是由一整個團隊在談，海基會現在只是一個平台，談判主要已由各部會負責與主導，「不能因為一個人的關係，就主張過去所談的都不算數。」
「陸委會與所有處理大陸事務的成員的努力，難道是假的嗎？」陸委會高層官員說，兩岸關係是一點一滴累積而來，目前談判已制度化，「未來將更制度化，讓它更堅實。」，